費用区分	保険診療	自由診療
1回あたり	約6,000円（3割負担）	約4,000〜20,000円
1クール（30回）	約17〜57万円（入院費込み）	約15〜60万円
初診料	約3,000円（3割負担）	約5,000〜15,000円
検査料	保険適用	約5,000〜20,000円
治療形態	原則入院（6週間）	通院可能

保険診療は1回あたりの費用は安く見えますが、原則として入院治療となるため、入院基本料や食事療養費などが別途加算されます。一方、自由診療は1回あたりの費用は高めですが、通院で受けられるため総合的な負担は必ずしも高くなりません。

ポイント：TMS治療の総費用は、「1回の治療費×回数＋初診・検査料＋付帯費用」で計算します。クリニックの提示する費用に何が含まれているかの確認が重要です。

保険診療のTMS治療にかかる費用

2019年6月にTMS治療が保険収載され、条件を満たせば健康保険でTMS治療を受けられるようになりました。ここでは保険診療で受ける場合の具体的な費用を解説します。

1回あたりの診療報酬

保険診療におけるTMS治療（反復経頭蓋磁気刺激療法）の診療報酬は、1回あたり約20,000円と設定されています。これに対する患者様の自己負担額は、加入している健康保険の負担割合によって以下のようになります。

自己負担割合	1回あたりの費用目安	30回分の費用目安
3割負担	約6,000円	約180,000円
2割負担	約4,000円	約120,000円
1割負担	約2,000円	約60,000円

入院費用が別途必要

保険診療のTMS治療は、原則として入院治療となります。そのため、TMS治療本体の費用に加えて以下の費用がかかります。

入院基本料（1日あたり約3,000〜15,000円程度／3割負担の場合）
食事療養費（1食あたり490円、1日3食で1,470円）
検査料（血液検査・脳波検査など）
診察料・管理料
差額ベッド代（個室利用の場合、別途5,000〜30,000円／日）

6週間の入院の場合、入院費用だけで総額50万〜100万円程度（3割負担で15万〜30万円）が目安となります。TMS治療費と合わせると、自己負担額は20万〜40万円程度になるケースが多いです。

高額療養費制度で負担を軽減できる

保険診療の大きなメリットは、月の医療費が一定額を超えた場合に「高額療養費制度」が適用され、自己負担の上限額が設定されることです。

たとえば、年収約370〜770万円の方（日本の一般的な所得層）の場合、1か月あたりの医療費の自己負担上限は約87,430円（※収入により変動）となります。6週間の入院治療の場合、2か月分が対象となるため、最終的な自己負担は15万〜20万円程度に抑えられます。

自由診療のTMS治療にかかる費用

保険適用の条件に該当しない場合、または通院で治療を受けたい場合は、自由診療（自費診療）でTMS治療を受けることになります。自由診療は保険適用外のため、費用は医療機関ごとに独自に設定されており、大きな開きがあります。

1回あたりの費用相場

自由診療におけるTMS治療の費用は、1回あたり約4,000円〜20,000円と医療機関によって大きな差があります。多くのクリニックでは、以下の価格帯に分布しています。

リーズナブル帯：1回あたり約4,000〜8,000円
標準価格帯：1回あたり約8,000〜15,000円
プレミアム帯：1回あたり約15,000〜20,000円

1クール（20〜30回）の総額

自由診療のTMS治療は、一般的に20〜30回を1クールとして実施します。1クール全体の費用相場は以下の通りです。

価格帯	1回あたりの費用	1クール（30回）
リーズナブル	約5,000円	約15万円
標準価格	約10,000円	約30万円
プレミアム	約18,000円	約54万円

付帯費用も考慮する

自由診療では、TMS治療本体の費用以外にも以下の付帯費用がかかる場合があります。トータルコストを把握するため、事前に確認しておきましょう。

初診料：約5,000〜15,000円
再診料：約1,500〜3,000円／回
検査料（血液検査・心理検査など）：約5,000〜20,000円
カウンセリング料：1回あたり約5,000〜10,000円（希望する場合）
診断書作成料：約3,000〜5,000円
薬剤処方料（自由診療の場合）

TMS治療の費用にバラつきがある4つの理由

保険診療は全国一律の診療報酬体系ですが、自由診療では1回4,000円〜20,000円と実に5倍もの価格差があります。なぜこれほどの差が生じるのでしょうか。主な理由を4つ解説します。

理由①：使用する治療機器の違い

TMS治療機器はメーカーや機種によって性能と価格が大きく異なります。FDA認証を受けたNeuroStar®やMagVenture社のMagPro®などの世界標準機器は、1台1,000万円以上する高額な機器です。特にNeuroStar®︎は1回の治療毎に使い捨てする高額なパッドを使用することから、どうしても価格を抑えられません。一方、FDA承認が通常のTMS治療のみで、iTBSなどに適応のないTAMASなど廉価版の機器もあり、導入コストが安い分、治療費も抑えやすくなっています。

ただし、コイルの性能、刺激の精度、出力の安定性などの違いが治療効果にも影響する可能性があるため、機器の種類は必ず確認することをおすすめします。

理由②：医師・スタッフの専門性

TMS治療は繊細な治療であり、刺激部位の特定や刺激強度の調整には専門的な技術と経験が必要です。海外での治療経験のある医師や海外での研修修了している医師が担当するクリニックでは、MagPro®︎など質が高く高価なパッドなど必要としない治療器を使いこなすことができるため費用が安価に設定されている傾向があります。

逆に、保険診療向けの短期間研修のみで治療を提供している施設では、NeuroStar®︎を使いますので費用は高くなる傾向にあります。

一部のクリニックでは刺激部位を決める手技が未習熟なままに治療をするところもあるようですので、注意が必要です。

理由③：治療プロトコルの違い

TMS治療には複数のプロトコル（治療方法）があります。従来の標準プロトコルのほか、iTBS（シータバースト刺激法）や短期集中治療プログラムなど、新しい手法を採用するクリニックでは、価格が異なることがあります。プロロングドiTBSやSAINTは治療効果がかなり高く刺激回数も多いため高額になっています。

理由④：立地・施設のグレード

都心部の好立地にあるクリニックや、豪華な内装・個室対応など設備が充実している施設では、運営コストが反映されて治療費が高くなる傾向があります。

注意：「極端に安い」「極端に高い」クリニックは要注意。

「極端に安い」ところの場合、FDA認証外の機器、経験不足の施術者、刺激回数の不足、専門医の監修がなく適応の診断ができないなど、治療効果や安全性に懸念がある場合があります。

「極端に高い」ところの一部には十分な治療実績がないにも関わらず適応のない疾患や正常な状態に施行し、高額であれば実績があると勘違いするだろうという悪質なクリニックもあるようです。

TMS治療の費用を抑える4つの方法

TMS治療は決して安くない治療ですが、利用できる公的制度や工夫によって経済的負担を軽減できます。ここでは費用を抑える4つの方法を紹介します。

方法①：高額療養費制度を利用する（保険診療）

保険診療のTMS治療を受ける場合、高額療養費制度を活用することで自己負担額を大幅に軽減できます。同一月内にかかった医療費が自己負担限度額を超えた場合、超過分が払い戻される制度です。

自己負担限度額は所得区分によって異なりますが、一般的な年収（370〜770万円）の方の場合、月額約87,430円が上限です。事前に「限度額適用認定証」を取得しておくと、窓口での支払い自体が上限額までに抑えられるため便利です。

方法②：自立支援医療制度を利用する（保険診療）

精神疾患の通院治療費の負担を軽減する「自立支援医療（精神通院医療）」制度を利用すると、通常3割負担の医療費が1割負担になります。ただし、この制度は通院患者さんにのみ適応されるため、ほとんどの場合が入院加療となる保険診療では適応が難しいと考えられます。適応の可能性がある場合には、お住まいの市区町村の窓口で申請が必要ですので、主治医に相談してみてください。

また、自由診療は入院、通院の別と関係なく制度の対象外となります。

方法③：医療費控除を活用する（保険/自由診療ともに）

1年間（1月1日〜12月31日）に支払った医療費が10万円（または所得の5％）を超える場合、確定申告により医療費控除を受けることができ、所得税・住民税が還付・軽減されます。自由診療のTMS治療も対象となります。

対象となる費用には、治療費本体のほか、通院のための公共交通機関の交通費も含まれます。領収書や交通費の記録を保管しておきましょう。還付される金額は所得税率によって異なりますが、年収500万円の方が40万円のTMS治療を受けた場合、約6万円の還付が受けられる試算になります。

方法④：民間医療保険を確認する

加入している民間の医療保険に「先進医療特約」や「通院治療給付金」などが付帯していれば、給付金を受け取れる可能性があります。契約内容は保険会社によって異なるため、事前に以下を確認してみましょう。

TMS治療が給付対象に含まれているか
通院治療でも給付されるか
給付金の上限額
診断書などの必要書類

他のうつ病治療との費用比較

TMS治療の費用を考える際は、他のうつ病治療との長期的なコスト比較も参考になります。一見高額に見えるTMS治療も、治療期間の短さを考慮すると必ずしも高コストとは限りません。

治療法	治療期間の目安	費用目安（月額）	総費用の考え方
薬物療法	6か月〜数年	約3,000〜10,000円	長期で累積
認知行動療法	4〜6か月	約20,000〜40,000円	保険適用は条件あり
ECT（電気けいれん療法）	2〜4週間	保険適用	入院費が中心
TMS治療（保険）	6週間	月10〜20万円	入院費込み
TMS治療（自由）	4〜6週間	月15〜30万円	一括のところもある

薬物療法は1回あたりの費用は安いものの、治療期間が数年単位になるケースも多く、副作用対策のための追加治療費がかかる場合もあります。一方、TMS治療は短期間で完了することが多く、再発予防効果も期待できるため、長期的視点では必ずしも割高とはいえません。

費用で失敗しないTMSクリニック選びのポイント

以下のポイントを確認することで、費用に見合った質の高い治療を受けられるクリニックを選べます。

費用の透明性

総額の見積もりを事前に提示してくれるか
「追加費用」「オプション費用」の説明が明確か
治療回数の目安が明示されているか
一括払いの場合、解約時の返金規定が明確か

支払い方法の選択肢

TMS治療の支払い方法には、主に以下のパターンがあります。ご自身のライフスタイルに合わせて選べるクリニックが安心です。

都度払い：治療のたびに支払う方式。途中で中止しても損失が少ない
チケット制：まとめて購入する方式。1回あたりが割安になることが多い
ローン払い：分割払いに対応しているクリニックもある

ただし、高額なローンを組んでまでTMS治療を始めることは、患者様の経済状況を圧迫する可能性があります。無理のない支払い計画を立てることが大切です。

治療の質を判断するポイント

使用機器がFDA認証されているか（NeuroStar®、MagPro®など）
担当医師がTMS治療の専門研修を受けているか
治療実績・症例数が豊富か
刺激部位の特定方法が精密か（5cm法より精度の高い測定法など）
治療効果の評価システムがあるか

関連記事：精神科と心療内科の違い

TMS治療の費用に関するよくある質問

Q1. TMS治療の費用は一括払いでないとダメですか？

A. クリニックによって支払い方法は異なります。多くのクリニックでは都度払い・分割払い・クレジットカード払いなど複数の選択肢を用意しています。中にはセット料金（一括割引）を用意しているクリニックもありますが、一括払いが必須というわけではありません。自分の支払い能力に合った方法を選びましょう。

Q2. 途中で治療を中止した場合、返金はありますか？

A. 都度払いの場合は中止後の費用は発生しません。セット料金やチケット制の場合は、クリニックの規定によって返金の可否や割合が異なります。契約前に必ず解約時の取り扱いを確認しておくことが重要です。

Q3. 学生や収入が少ない人でも受けられますか？

A. 自由診療は高額になるため、学生や収入が限られている方にとっては経済的負担が大きい場合があります。保険診療の対象となる方は、高額療養費制度や自立支援医療制度の活用をおすすめします。また、ご家族と相談のうえ、治療の優先順位や支払い計画を検討しましょう。借金をして治療を始めることは推奨されません。

Q4. 交通費は医療費控除の対象になりますか？

A. はい、通院のための公共交通機関（電車・バスなど）の交通費は医療費控除の対象となります。タクシー代は、歩行困難な場合などやむを得ない事情がある場合に限り対象となります。領収書や通院記録を保管しておきましょう。

Q5. TMS治療を受けると薬代が減るのでトータルで安くなりますか？

A. TMS治療の効果が出た場合、抗うつ薬の減量・中止が可能になるケースがあり、長期的には薬代が減る可能性があります。ただし、自己判断で減薬するのは危険ですので、必ず主治医と相談しながら進めてください。また、薬物療法の通院費用（診察料・処方料）も削減できる場合があります。

Q6. 効果が出なかった場合の費用はどうなりますか？

A. 原則として、効果の有無にかかわらず受けた治療の費用は支払う必要があります。ただし、効果判定のタイミング（治療10回目・20回目など）で改善が見られない場合、治療計画の見直しや他の治療法への切り替えを提案してくれるクリニックもあります。効果保証を謳うクリニックは医療広告ガイドラインに抵触する可能性があるため、注意が必要です。

新宿・代々木こころのラボクリニックのTMS治療

新宿代々木こころのラボクリニックでは、r-TMS療法を自由診療で提供しており、患者様一人ひとりの症状や生活スタイルに合わせた柔軟な治療プランをご用意しています。費用面についても、事前に明確な見積もりをお示ししたうえで治療を進めておりますので、安心してご相談ください。

当院のTMS治療の特徴

・良心的な料金設定：1回6,600円（税込）と保険３割負担の方の自己負担額とほぼ同程度の料金設定を実現しています。

・通院で治療可能：入院の必要がなく、お仕事やご学業を続けながら治療を受けていただけます。

・平日夜・土日も診療：平日は21時まで、土日も診療を行っており、通院しやすい環境を整えています。

・完全予約制で待ち時間少：他の患者様と顔を合わせにくい配慮もしています。

・認知行動療法との組み合わせ：TMS治療単独ではなく、認知行動療法やマインドフルネスと併用することで、より包括的で効果的な治療が可能です。

・共同意思決定（SDM）：患者様の価値観や経済状況を踏まえ、無理のない治療プランを一緒に検討します。

費用に関するご相談も承ります

「自分の症状にTMS治療が適しているか」「費用対効果を含めて、他の治療法と比較したい」「医療費控除や支払い方法について相談したい」——こうしたご相談も随時承っております。まずはお気軽にお問い合わせください。

完全予約制となっておりますので、事前のご予約をお願いいたします。治療費用の詳細については、初診時にご説明いたします。

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まとめ

TMS治療の費用について、本記事の要点を整理します。

保険診療では1回約6,000円（3割負担）、1クール約10〜20万円（入院費・高額療養費適用後）
自由診療では1回約4,000〜20,000円、1クール約15〜60万円と医療機関により幅が大きい
費用を抑える方法として、高額療養費制度・自立支援医療・医療費控除・民間医療保険の4つがある
費用のバラつきは機器・医師の専門性・プロトコール・立地などの違いによる
費用だけでなく、治療の質・透明性・自分の症状への適応を総合的に判断することが大切

TMS治療は決して安価な治療ではありませんが、うつ病の治療期間短縮や再発予防、薬物療法からの卒業など、長期的に見れば大きなメリットがある治療法です。費用に関する不安やご質問がある方は、新宿代々木こころのラボクリニックまでお気軽にご相談ください。透明性のある費用説明と、無理のない治療プランをご提案いたします。

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新宿・代々木こころのラボクリニック
平日21時まで。土日診療有り。新宿駅直結徒歩5分。代々木駅東口徒歩4分。